另外，太宗还对房杜给予了充分的信任。
贞观三年，监察御史陈师合上了一篇《拔士论》，文中指出一个人不可以担任数个职务，暗中其实是讽喻杜如晦等任职太多。太宗看了说：“玄龄、如晦不是因为有功才受到重用的，而是他们的才干确实可以助朕治理天下，师合难道想以此文来离间我们君臣吗？”下令将陈师合发配到岭南去。
贞观十八年（644），太宗亲征辽东，命玄龄留守京城，处理日常政务。并准许玄龄不用奏请批准，就可以直接拿主意，处理各种军国大事。在这期间，正好有人上访，声称要秘密告发一个人。
玄龄接见了他，问：“你声称要告发一人，那人是谁？”
回答说：“就是你房大人。”
房玄龄看着此人，想了一会儿，径直走出屋去，吩咐侍从：“派人将他送到皇上那里。”言罢便拂袖而去。
却说太宗听说留守房玄龄送来一个告密人，眉头一皱，很不高兴。一边命人持长刀站在旁边，一边叫那人进来。
“你想告发的人是谁？”太宗盯着他，问道。
“回皇上，是房玄龄。”
“果然是这样。”太宗自言自语，然后回头对持刀的侍卫：“拉出去腰斩。”
“陛下，还没有听草民要告什么啊，陛下饶命啊！”告密者脸色大变，连声求饶。
太宗也不理他，挥一挥手，让人将他拖了出去。
几日之后，玄龄收到太宗的来信，责怪他如此不自信，称“再有这样的人，你该怎么处理就怎么处理，不要因为与自己有关就有所顾忌。”
太宗对房杜的信任由此可见一斑。这种信任是建立在充分了解的基础上的，也是太宗自信的一种表现。君臣都如此优秀，也难怪后世常称贞观时期是君明臣贤了。
而更难得的是房杜二人同为英才，但都没有“既生瑜，何生亮”的感叹，能够精诚合作，互补长短，共助圣君。房玄龄知道杜如晦能够决断大事，而杜如晦则明白房玄龄善于提出好计谋，双方都明白只有两人相辅相成，方能建立奇功。
贞观三年（629），太宗与群臣谋事。大家意见不一致，事情怎么办，迟迟没有决定。太宗一时也拿不定主意，看看下面的人，说：“怎么杜如晦不在啊？他这个人最会拍板。快去召他来见朕。”
旁边的侍从得令，马上去请杜大人。一会儿工夫，人来了。
“参见陛下。”杜如晦一进来就拜。
“不用多礼了，杜卿家。正有一事不决，朕想听听你的意见。”
于是众人又将各自的意见说了一遍。杜如晦听罢，沉思片刻，说：“臣以为采用房大人的意见最为合适。其他办法都有不周全之处。”
太宗表示赞同，立即差人按房玄龄的意见去处理。
隔了几日，事情圆满解决了，太宗很是高兴。对着房、杜还有群臣说：“人言房谋杜断，果然不虚啊。”
的确，在国家政务的决策过程中，需要善于献策的谋略者，也需要当机立断的拍板人，房杜二人正是各当其任。两人这种相知基础上的合作，发挥了各自的才能，建立起了良好的工作气氛和人事环境，保证了政务处理的准确与高效。他们的合作成就了自己，也成就了对方，既是贞观之治得以形成的条件，也是贞观之治成就的一种表现。
可惜的是，贞观四年（630）三月，杜如晦就逝世了，离开了他的主公和朋友。太宗悲痛难当，之后更是常常想念这位臣子，并流着泪对他的好搭档房玄龄说：“公与如晦同佐朕，今独见公，不见如晦矣！”房玄龄也是唏嘘不已，君臣相对无言。