根据《三论玄义》所讲，三部论皆以“破邪显正”为宗，“破邪”即是破斥外道的一切邪执邪见，“显正”即是申展如来正教。表示实相正法无住无著、无得无依，所以说三论以“无所得正观”为宗，若就三部论分别而各有差别，《中论》以真俗二谛为宗，《十二门论》以境智为宗，今《百论》以权实二智为宗。
为什么说《百论》以权实二智为宗？因为《百论》的产生，主要是提婆菩萨破斥各家外道的理论主张而所说的言论。不同于龙树的《中论》、《十二门论》是龙树大士在自己的居住处，思惟、研究外道的理论而写出的论文。《百论》是提婆菩萨在与外道当面对辩，没有思考研究的充分时间，需要头脑的清醒、智慧的辩才，才能使外道屈服，这样必须要具备权实二智。也就是说要具备善巧方便智和真实无碍智，对外道的思想理论能当机立断予以反驳，并且使外道没有还口之地，这非常人所能为，因此说《百论》是以二智为宗。
正因为《百论》是因破外道而造，所以《百论》以“破邪”为主，但破邪又不离显正，只是偏重于破邪而已，“邪”尽“正”自申。《百论》虽破外人，但又自己不立一法，因此《百论》云：“言而无当，破而不执”，虽然破外道实无可破，因为外道有执才破，若邪见即除则不需破。既然所破即除，能破亦舍，所以说破如可破，破可破既去、亦破可破、非破可破，四句内外一切不依，亦不见无依，如此踪迹不可得，则无难不通。若破而反执，则无通而不难。因此《百论》是破而不执，才能通而无难，将外道彻底驳倒，使得其心服口服，甘愿剃发出家为佛弟子。
所以《百论?序》云：“百论者盖是通圣心之津途，开真谛之要论。”说明了《百论》是破众生邪见而通向圣道的必经要道，众生迷惑不悟，《百论》如同灯光照明了黑暗，是打开如来真谛的论点，唯有破除迷执，才能显现真谛。我们学习《百论》就是为了破我们众生的迷执和邪见，分别虚妄之心，使人们能够悟入诸法实相之本性。《百论》在一千年前破众生迷惑，能令众生悟入正道，一千年后的今天仍然适合于我们，可见真理永远是不能改变，只有经过历史的检验才能称真理。《百论》经过历代高僧大德的研究和探讨，代代相传流传到现在，使每一个修学佛法者必须应了解和掌握。