更坏的情况还在后面。在吕宋岛大败之后，日本在1945年3月的琉磺岛和6月的冲绳的两次所谓“天王山”式的决战中相继失败。形势已经变得越来越清楚，最终的“天王山”决战就是日本本土的保卫战。
到了这个时候，小矶国昭和其他务实派的领导人意识到日本在大战中已经失败了，于是他们开始伸出和平的触角，进行试探。
可悲的是，日本人的骄傲和日本的传统，使他们不可能用西方人能够理解的方式来寻求和平。于是他们还要继续为保卫日本进行准备。
在制定最后决战计划的时候，陆军的首脑们很坚定地相信：美国人已经像鼓足了气的气球，只要有一次毁灭性的失败，就可以迫使他们放弃大战。但是由于一味坚持这个观点，他们忽视了两个事实：第一是美国的潜艇已经击沉了大部分日本商船，使燃料、食品和原材料这些关键物资的进口几乎断绝；第二是美国的飞机正在把日本的工业城市炸成一片片废墟。
2月6日，在位于东京市谷的日本陆军总部，陆军的作战指挥部正式批准了一项保卫日本的新政策。宫泽秀一中将向参谋本部的将领们做了一个现实的简单报告，内容就是关于即将失守的菲律宾的情况，但是他宣称道：“我们现在正在组织16个师的力量，准备投入本土的保卫战，我们将在这一战中扭转大战的形势。在敌人登陆后的两周之内，我们会注入20个师的兵力，我们将彻底消灭敌人，确保日本的胜利。”
第二天，宫泽秀一会见了日本六大军区的指挥官，将新征召来的16个师和任何能从满洲调回来的部队在它们中间进行了分配。他说，在任何美军可能登陆的地区，日军将以三比一的对比迎击他们。
指挥官们预测，美军最可能的进军路线一个是从中国大陆越过日本海，一个是从冲绳北上。他们把南方的九州岛作为最主要的防御阵地，所有的战备工作将在夏天之前完成。他们一致决心不惜付出任何代价，如果不能取得最后的胜利，那么整个日本的命运就是“玉碎”———宁为玉碎，不为瓦全。
陆军在2月底时公布了本土的防御计划。宫泽秀一将军在一次群众集会上说：“战争的进程最后将迫使敌人在我们自己的土地上和我们交战。自从瓜岛撤退以来，陆军一直没有什么机会和敌人在陆地上作战，但是当我们在日本本土交锋的时候，我们的陆军将显示出不可战胜的优势。”
在2月底举行了一次为期三天的陆军高级军官会议，这次会议制定了更加周密的作战计划。军官们保证将会有40个师迎战前来入侵的敌人，并且估计如果放宽征兵的年龄限制，还可以增加150万人的兵力。防御战的最主要特征就是对预期中敌人登陆的海滩进行一系列的反击。日本士兵将会以排山倒海之势把敌人赶回大海，这将会是人类历史上最血腥的战役之一。