光绪三十四年（１９０８）十月二十二日，慈禧太后病死于西苑的仪鸾殿。在办理慈禧太后的丧仪之后，离慈禧太后死日还不到一百天，李连英就于宣统元年（１９０９）的二月初二日离开了皇宫，这时他在皇宫内已生活了五十多年。在他的墓志碑文中是这样说的：“及太上孝钦显皇后升遐，公之退志决矣。”由此可见，李连英是主动提出离宫的。据清宫档案记载，当时内宫主政的隆裕太后，为感谢他宫中服役多年，准其“原品休致”。就是可以带原薪六十两钱粮米退休，这个待遇在当时可以说在太监中是绝无仅有的。
围绕李连英出宫及身后各事，社会上又有许多传说。有人说他自光绪皇帝的弟弟醇亲王载沣监国摄政以后，恐遭报复，而退居宫外，以保全自己的脑袋；也有人说，李连英死后，宫中太监纷纷抢夺其遗产，隆裕太后下令查办，将其悉数充公，并用于宫中大兴土木，购置西式家具，等等。类似这样的传闻，一时非常盛行，这些诋毁多出自于一种感性的发泄而已。更奇的是还有人说，李连英生前得罪了许多人，出宫后就深居简出，怕人报复，但最终还是被人在后海附近暗杀，落了个身首异处的下场。在讲这个故事的时候，还暗示了这桩凶杀案与民国初年任步军统领的江朝宗有关。但仔细查阅江朝宗的档案履历，发现１９１１年３月李连英死的时候，江朝宗还远在陕西汉中总兵任上，可见这些传说纯属无稽之谈。
李连英出宫两年后，于宣统三年（１９１１）二月初四日悄无声息病死在北京自己的寓所里，时年六十四岁。而此时绵延了二百多年的大清帝国，也已经风雨飘摇，危在旦夕了。尽管如此，清宫里隆裕太后对这个一辈子为其当牛做马的忠顺奴才的死，还是十分伤悼，于是下令赐银千两，赏埋京西恩济庄太监茔地。
李连英死后的丧葬规格在清宫太监中也是最高的。他的坟墓，被允准建在恩济庄太监茔地中一个独立的院落里，前面有石柱桥及牌坊，牌坊横眉上书“钦赐李大总管之墓”，院内东西侧各有亭子一座。由于是太监，不敢僭制，其墓顶用三合土（即糯米浆合沙土、黄土、白灰而成）建筑。他的墓碑是用汉白玉制成，高三点五米，宽一米许，其规格实为历朝太监无法比拟了。惟有一条，因为生前名声不好，那些名臣显官、文人清士难觅一人为其撰写墓志碑文，无奈只好由晚辈子侄代笔，来进行一番自我吹捧和美化。这也是传奇太监李连英宠辱一生的最后缺憾了。
作为一个太监，他的皇室奴仆身份和千百个同行一样，是无法更改的。他们一样有着苦难、屈辱的童年，有着残缺的身体和残缺的生活，一样享受不到家庭和亲情的温暖。所不同的是，由于得到了慈禧太后的赏识和宠信，李连英的后半生发生了奇迹般的变化，正是在慈禧太后的庇荫下，他得到了宫内前所未有的权力和地位，金钱财富也滚滚而来，然而也正是得益于慈禧太后的惠顾，李连英也和他的主子慈禧太后一样，成了中国近代史上一个臭名昭著的人物。
这就是太监李连英传奇的宠辱一生。