豪格失落皇位，于心不甘，他并未反躬自责，而是把一肚子郁闷倾泄到多尔衮身上，由此又引发他人生的第三次大挫折。
顺治元年（1644）四月，也就是福临即位七个月后，豪格所领正蓝旗的固山额真（八旗的最高将领）何洛会出面检举豪格“图谋不轨”，揭发他经常散布不利于多尔衮的言论，如说“睿亲王素善病，岂能终摄政之事”，又说“睿亲王非有福之人，乃有疾之人，其寿几何而能终其事乎”。甚至四处扬言：“我（豪格）岂不能手裂若辈之颈而杀之乎？”当时的清朝，正准备大举入关，全国上下，本当同仇敌忾，豪格散布这些流言蜚语显然不得人心。多尔衮乘势对豪格加以打击。他召集诸王大臣会审，豪格的心腹固山额真俄莫克图、议政大臣杨善、伊成格、罗硕等，均以“附王为乱”罪名处死。豪格本人也差点送命。诸贝勒大臣请杀豪格，只是由于幼帝福临念及这位长兄的骨肉之情，终日啼哭不食，才使豪格免于一死，但受到没收七牛录人员，罚银五千两，废为庶人的重惩。
同年十月，福临由盛京迁北京，再次举行即位典礼，大封诸王。念及长兄豪格的功勋，仍恢复其肃亲王爵位。但经此番挫折，豪格的实力已严重受损，名誉也大不如从前了。
顺治三年（1646）三月，豪格任靖远大将军，统率大军自陕入川，开始了他一生最辉煌的军事业绩。在四川，他连败张献忠领导的大西军。清军进入西充，时值大雾弥天。张献忠刚愎自用，不信清军神速，未加提防。豪格大军突至，张献忠仓促间被一箭射中心脏，当即死去。于是后世编造出一个荒诞不经的故事广为流传，说张献忠在一座古塔中拆出了一块石碑，碑文写着：
于化龙是明朝战将，明万历四十七年（后金天命四年，1619）殁于萨尔浒大战。所谓“吹箫不用竹”，是指箫字去掉竹字头为一肃字，指张献忠毙命于肃亲王箭下早有预兆。清人樊彬在《燕都杂咏》中吟有：
“名王”，指豪格。“偃盖松”是指豪格墓地上生长的巨松，枝干横生，绿荫匝地，倚靠红漆木架支持，成为清代京师的一大盛景（遗址在今北京东南部的劲松小区）。其实，真正射死张献忠的不是豪格，而是他的部将雅步兰。雅步兰是神射手。
豪格在四川，与著名的耶稣会传教士利类思、安文思有过一段交往。民国初年，法国传教士古洛东根据他们留下的教会档案和中国史料，用中文撰写了《圣教入川记》一书。书中记载了利类思、安文思与豪格的多次交往。那么，传教士眼中的豪格是怎样一个人呢？
对西洋科技有浓厚的兴趣。二传教士在逃难途中被清兵抓捕，因相貌怪异，被送到统兵元帅肃亲王前。豪格问传教士关于机器的知识，还授意他们把天文书详加解说，译成满语。豪格阅后，“大为惊异，以为闻所未闻，见所未见，称赞不已”。顺治帝曾任传教士汤若望为钦天监监正，尊为“玛法”（满语“爷爷”的意思），在天文、历法等方面时常求教，康熙帝对西洋科技的痴迷也广为众知。如果说豪格是满洲王爷中较早对西洋科技产生浓厚兴趣者，应该大致不错。
对传教士待之以礼。豪格与西洋传教士有长期交往，在京师时与著名传教士汤若望关系很熟，所以汤若望托他到四川后保护传教士。豪格履行了自己的诺言，对传教士“宠渥有加，每日赐肉给米，妥为照顾”。二位教士对豪格的“宽仁厚德”印象深刻，颂扬备至。有一次言谈之余，传教士提到，他们有一位中国仆人在逃难中走失，生死未卜。豪格立即吩咐人持令箭速到各营寻访。结果发现此人被一旗人掳获。该旗人开始不愿放回，后来听说是肃王命令，将仆人亲自送回。从豪格与传教士的交往中，或者可以了解他善解人意的一面。
军纪严肃。一次路途行军，利类思因腹中饥饿，在路边菜地中翻检聊以充饥的食物，被旗兵看见，以为是汉人私入他人田亩，即张弓搭箭向他瞄准，如果不是另一旗兵拦阻，利类思定已中箭。后来旗人向司铎（神甫）说明，“不可路外而行，误犯军规，以遭不测”。这说明，肃亲王治军严整，士兵不敢违犯。这应是清军征剿张献忠大西军所向披靡的一个原因。
顺治五年（1648）二月，豪格率大军抵达京师。顺治帝亲自在太和殿设宴犒劳风尘仆仆、凯旋归来的长兄与诸将领。豪格也因与诸兄弟久别重逢欢喜不已。然而，随之而来的却是他人生的第四次、也是最后一次大挫折。
豪格回京只享受了一个月的自由，就被人举报。先是一批以贝子吞齐为首的贵族，检举郑亲王济尔哈朗，在罗织的各项罪名中，与豪格有关的两条：一是说当皇太极逝世时，“谋立肃王（豪格）为君”，“擅谋大事”；二是偏袒受到罢爵处分的豪格，让豪格的妻子在豫亲王多铎、英亲王阿济格的福晋前面行走。并得出济尔哈朗“向与肃王同谋，心生怜悯，显令僭越”的结论。郑亲王济尔哈朗被定以死罪，后从轻处置，降为郡王，罚银五千两。皇太极生前，对济尔哈朗多有恩宠，济尔哈朗对豪格也多有关照。郑亲王失势，豪格失去了最后一个保护伞，唇亡齿寒，结局也就可想而知了。
处理济尔哈朗两天之后，多尔衮召集诸王大臣会议，专门讨论豪格的问题。这时的摄政王多尔衮，大权独揽，惟我独尊，连顺治帝也奈何他不得，诸王大臣更是仰其鼻息，唯唯诺诺。于是以豪格犯有庇护部将、冒领军功及欲提拔罪人之弟等轻微罪名，定其死罪。多尔衮假惺惺地表示不忍，诸王大臣揣摩多尔衮的意旨反复上奏，甚至引“太祖长子（即褚英）曾似此悖乱，置于国法”为前例，坚持严惩不贷。最终，免豪格一死，囚禁狱中，削去爵位，没收所属人员。
豪格身陷狱中，生不如死，绝望到了极点，对人说：“把我释放也就罢了，不然的话，我一定要用石头把这帮小子砸死！”不久，便因激愤卒于狱，年仅40岁。
关于豪格的死因，除了“卒于狱”，还有“自杀”或被多尔衮“谋杀”等不同版本。信修明在《老太监的回忆》中提到：豪格凯旋回京，皇上派摄政王迎于永定门外。肃亲王按例先拜谒皇叔（多尔衮），不意幕中伏兵四起，乱刀齐下。肃亲王的太监王忠扑在豪格身上，与他同被剁为肉酱。装殓时血肉不能分，同敛一棺。后世肃王府用太监，只许用，不准打骂，因王忠同王殉难，且同葬一处。但这种说法的可信程度不大。豪格毕竟是太宗长子，战功卓著的军事统帅，凯旋之日，却被摄政王部下不分青红皂白乱刀砍死。如果这样的话，即便是位高权重的多尔衮，对皇上、诸王和天下臣民也不好交代，况且这也不符合多尔衮面对棘手问题时机敏灵活、缜密谨慎的一贯作风。
多尔衮逼死豪格，又将其福晋纳为妃，于良心似有愧怍，所以对豪格的儿子富绶多方呵护，还让他到自己的府第担任校射。多尔衮的亲信何洛会对此很不理解，说：“见到此人，就令人心悸，为什么不除掉他?”多尔衮回答：“因为你们不知道我是爱护他的。”这样，豪格的儿子幸存下来。
多尔衮逼死豪格，顺势将他名下的正蓝旗据为己有。不久，他的弟弟豫亲王多铎出痘身亡。多尔衮实领两白一蓝三旗，在朝中形成莫与争锋的实力。
两年以后多尔衮猝死，年轻的顺治帝提前亲政。念长兄豪格蒙冤而死，为他平反昭雪，恢复和硕肃亲王爵位，并立碑对他一生的功绩进行表彰。十三年（1656），追加谥号为“武”。在清代满洲贵族中，豪格是第一位按照汉族惯例被赐予谥号的王爷。乾隆四十三年（1778），豪格因开国功绩，配享太庙。
清初肃亲王豪格的府第位于玉带桥东岸（今东交民巷正义路东）。前后共有10位府主生活于此。庚子年（1900）八国联军入侵北京，王府毁于兵火。战后签订的《辛丑条约》，把王府所在的大片土地划为“使馆界”。肃亲王府迁至北新桥船板胡同（今东四十三条）街北。但新府已非王府形制。
过去，北京人谈起旧时北京的王府，常说：“礼王府的墙，豫王府的房，肃王府的银子用斗量。”礼王府和豫王府的建筑的确好于其他王府。清初第一代肃亲王豪格统兵追杀张献忠，立下大功，为此，他得到的财富也多于一般的王公。但众人都知肃王府银子多，王府内的银子如何收藏却鲜为人知。肃王府的藏银方法很奇特，是用整张刚剥下的鲜牛皮将银子包好，再用牛筋缝严，待牛皮风干后坚固无比，若想取出银子，必须用刀割破牛皮。这不但使窃贼无法偷窃，即使府内人等也休想打它的主意。这种方法非常有效，历代肃亲王都使用它。