建立审理机构，完善相关制度军队和监狱是国家机器的重要组成部分。如果说成吉思汗确立千户制、扩建怯薛军，主要是加强军队建设的话，那么他宣布各种号令，颁布大札撒，则是创建法律制度。法律既需要有人制定，更需要有人贯彻执行，因此“治政刑”的“断事官”首先从无所不包的怯薛军中分化出来，成为蒙古汗国最早的一批专职官员，于是审判机构、监狱应运而生了。蒙古汗国建立后，成吉思汗分封千户、万户，特将诃额仑夫人的养子失吉忽秃忽封为蒙古汗国的大断事官，这个大断事官不仅掌握全国的司法大权，而且掌握全国的户口青册，掌握财赋大权，同时还有权与大汗直接拟议，他所发布的命令具有法律性质，别人不得更改。于是大断事官成为兼管司法和财政的官职，被人们称为“国相”，与汉族的丞相一样在国家政治生活中具有举足轻重的地位。直到忽必烈至元二年（1265），元朝设立大宗正府，大断事官才专主宗正府，治蒙古宗室事并兼理刑名，才不再是行政长官了。在大断事官之下设有若干断事官，为其僚属、下级。诸王、贵戚、功臣有封地者，也各置断事官管治其本部百姓。在失吉忽秃忽担任大断事官时，蒙古汗国颁布了户口青册和大札撒，逐步制定了一套案件审理办法，如规定“犯罪者除现行犯外，非自承其罪者不处刑”，目的是防止误审错判，防止出现冤、假、错案。成吉思汗建立的政治制度，当时还很不完善，尽管军事和刑法有了一定分工，但各种政权机构还很不健全。在南征和西征的过程中，成吉思汗从畏兀儿、西夏、女真等先进民族吸取了不少统治经验，于是又陆续扩充了一些新的管理机构，国家政权才逐步趋于完善。
蒙古汗国的建立，结束了我国北方草原长期的部落纷争，成吉思汗采取的一系列政治经济措施，使蒙古草原的统一得到了进一步巩固。如果说成吉思汗及其子孙在西征中建立的大蒙古汗国还是不稳固的军事行政联盟的话，那么应该肯定的是，蒙古族成为一个有共同经济基础、共同风俗习惯、共同文化语言的真正统一的民族，与成吉思汗的贡献是分不开的。
南下伐金女真族原来是在辽朝统治下的弱小民族，但女真人向来以能征善战著称于世，“人一满万，天下无敌”，这是世人对女真人的评价。后来完颜阿骨打率领数千人起义，领导了对辽国的反抗斗争，只用了几年时间就灭辽国，建立了金国。随后又南下攻宋，俘虏了徽、钦二帝，中国北方出现了一个富庶强大的金朝政权。直到成吉思汗南下时，金朝人口已经发展到近5000万，比当时的蒙古多40余倍；军队也在百万以上，比蒙古多出10倍。因此当时有人曾说：“金国如海，蒙古如一掬细沙。”然而战争的结果，却是“一掬细沙”填平了“大海”。
综观蒙古与金的战争，其爆发的原因可以归纳为三条：一是蒙古各部反抗金朝的民族压迫；二是蒙古贵族要求对中原地区进行经济掠夺；三是成吉思汗君臣希望入主中原，与其他民族的统治者争夺对中原地区的统治权。《元史》及《宋史纪事本末》等书曾简单地揭示了成吉思汗伐金的原因，《宋史纪事本末?蒙古侵金》记载说：“先是，绍兴中，金人屡击蒙古不能克，遂与之和。金主尝遣卫王允济往靖州受铁木真之贡，允济奇其状貌，归言于金主，请以事除之，金主不许。铁木真闻而憾之。”《元史·太祖纪》说：“初，金杀帝宗亲咸补海罕（俺巴孩汗），帝欲复仇。会金降俘等具言金主璟肆行暴虐，帝乃定议致讨。”《元史·木华黎传》则说：“金之降者，皆言其主璟杀戮宗亲，荒淫日恣。帝曰：‘朕出师有名矣。’”《多桑蒙古史》分析成吉思汗伐金的原因，其中说成吉思汗出师以前，登上高山，祈天之助，解带置项后，脱其衣纽，跪祷曰：“长生之天，阿勒坛汗（指金帝）辱杀我诸父别儿罕、俺巴孩二人，脱汝许我复仇，请以臂助；并命下地之人类以及善恶诸神联合辅我。”《蒙鞑备录》从经济方面揭示成吉思汗伐金的原因，说是为了抢夺“繁庶”的民和物，因此史书上关于蒙古军队掠夺奴隶、抢劫财物的记载比比皆是。这种情况不仅表现在蒙古灭金的战争中，而且在以后的西征中也有充分反映。而金朝柔弱愚鲁的永济继位称帝，正好为成吉思汗伐金提供了有利时机。成吉思汗不失时机地做出了伐金的战略决策，于1211年秋，完颜永济集中金朝全国的45万主力，与蒙古10万军队在野狐岭展开了一场大决战。结果金军主力大败，后军溃逃，伏尸百里。正如一位史家所说：“此战也，金朝百年兵力销折溃散殆尽，其国遂衰。”野狐岭之战是金朝失败、蒙古胜利的大转折，又是中国古代军事史上以少胜多的典范战例。由于金卫王永济的用人不当，一仗输了金国的元气，但他反过来却把责任推在徒单镒的身上，对败军之将胡沙虎等却赏罚不明，结果养痈遗患，反受其害。
不久，金将胡沙虎发动政变，杀死卫王永济，改立金宣宗。随后铁木真乘胜进攻金朝的首都中都，金帝被迫献出公主和500童男、500童女求和，成吉思汗撤兵。新皇帝害怕蒙古再次进攻，不顾徒单镒和太学生的反对，决定迁都南京（今开封）。成吉思汗包围了中都，1215年，中都被攻破。成吉思汗下令将中都城府库的财物运往蒙古草原，随后又下令允许蒙古将士入城抢劫。金中都陷入一场灭顶之灾，大火月余不息，一座繁华的都城变成了废墟。
回师草原成吉思汗称汗之前，曾亲口答应其功臣豁儿赤可以在部中选取30个美女作妻子。正是因为豁儿赤坚持要到林木中部落选30名美女，引起了秃麻部女首领塔儿浑夫人起兵反叛。为了平定这场叛乱，成吉思汗从征金前线回师草原，并为此付出了重大牺牲，成吉思汗的义弟、四杰之一博尔忽战死。成吉思汗准备亲征，在众将劝阻之下，才另派大将率军征服了塔儿浑夫人。