尽管不排除"美国人将干预这场冲突并给南朝鲜提供积极帮助"的可能性，而人民军的数量及其拥有的物质力量现在还不能保证完全粉碎南方军队和占领南朝鲜，但他仍然认为，"发展朝鲜南部的游击运动并给予各种各样的支持和领导是可能的和适宜的"，在有利的形势下，"可以利用南朝鲜人在三八线上的挑衅，并且作为对他们破坏三八线的惩罚，占领瓮津半岛和开城地区"。
9月24日，联共(布)中央政治局讨论了朝鲜的局势，并做出决议，责成什特科夫严格按照决议的文本向金日成和朴宪永声明："由于目前北朝鲜的武装力量与南朝鲜相比没有占必不可少的优势，因此不能不承认，现在进攻南方是完全没有准备好的，所以从军事角度看是不允许的"。由于南方的游击运动和群众斗争没有积极开展起来，建立解放区和组织人民起义的工作进行得很少，"从政治方面看，你们建议的对南方的进攻也是没有做好准备的"。此外，进攻瓮津半岛和占领开城地区的局部战役就意味着"朝鲜南北战争的开始"，而战争的持久性"可能给美国人对朝鲜事务进行各种干涉提供借口"。
所以，"目前争取朝鲜统一的任务要求集中最大力量：第一，开展游击运动，建立解放区，在朝鲜准备全民起义，以便推翻反动政权和成功地解决整个朝鲜统一的任务；第二，进一步全力加强人民军"。这一决议表明，莫斯科此时的方针显然是希望通过南朝鲜内部的人民革命而不是由北朝鲜采取军事手段来达到统一朝鲜半岛的目的。值得注意的是，在布尔加宁、葛罗米柯等人起草的另一份指示稿中，还要什特科夫提醒金日成，"他们远没有充分利用争取以和平方式统一国家的一切可能性，如祖国阵线关于和平统一国家的宣言这样一个重要的和政治上对他们十分有利的文件"。这进一步证明，苏联领导人从其整体战略出发，此期主要考虑的还是采取和平方式解决朝鲜问题。
金日成等朝鲜领导人虽然勉强接受了莫斯科的意见，但并没有完全停止采取军事行动的计划。10月14日，三八线附近又发生了激烈战斗。朝鲜民主主义人民共和国第3警备旅对侵入三八线以北1.5公里法音山高地的南朝鲜军队展开攻击，并占领了这两个高地。由于苏联大使和军事顾问事前参与讨论并默许和支持了这一军事行动，而事后又未向莫斯科报告，斯大林对此极为不满。葛罗米柯严厉指责什特科夫没有"严格地、坚定地"执行"禁止未经中央允许而向北朝鲜政府建议对南朝鲜采取积极行动"的指示以及"中央关于防止三八线形势复杂化的指示"，并对他提出警告。
在此同时，斯大林还与毛泽东交换了对朝鲜政策的意见，他们从不同的角度出发，都认为北朝鲜此时不宜采取进攻性的军事行动。毛泽东在去电中说，朝鲜同志想通过武力解决南朝鲜问题，中国领导人曾劝阻他们不要这样做。斯大林回电说，完全同意中国同志的意见，在朝鲜不应开始一场战争，不能用军事手段统一朝鲜。目前北朝鲜还没有准备好，最好的办法是在南朝鲜组织游击队。
如果说随着南朝鲜"大韩民国"政权的建立，在政治上朝鲜半岛分裂已既成事实的话，那么随着苏联的撤军、南北双方各自建立军队，使得南北由分裂走向对抗迈出了最实质的一步。
1947年9月，美国参谋长联席会议除主席布莱德雷外，其他成员提出了把军队撤出朝鲜的建议，说：参谋长联席会议认为，从军事安全的观点来看，美国保持目前在朝鲜的军队和基地，并无战略价值。可是，这时美国总统派遣陆军负责作战计划的副参谋长魏德迈中将前往实地考察，他关于美军是否撤离朝鲜的问题作出了相反的报告。他认为：当苏联军队仍然占领着北朝鲜的时候，美国军队就必须把他的军队留在南朝鲜，不然的话，就等于向全世界承认"精神上退却"。这样，美国的军事地位就会随之降低，不但在远东是这样，在全世界也是这样。……魏德迈说，立即撤离朝鲜，从战略观点看，这种办法是不能接受的。无限期占领下去，在苏联军队撤走以后，会遭到美国人民和全世界的反对。最好的办法是和苏联达成协议以后，美、苏两国军队同时撤出。在撤出以前，由美军帮助南朝鲜建立和训练一支国防军。
美国总统采纳了魏德迈的建议，加紧武装南朝鲜军。在这个基础上，美国还是想把朝鲜"统一"到能代表美国利益的人手中。他们向"联大"提出，建议在联合国监督下，于1948年3月31日前在南、北朝鲜两个地区进行选举，以此作为建立全国性政权的第一步。建议成立一个联合国朝鲜临时委员会去监督执行。美国所以这样提出问题，是因为当时联合国的各个机构，受美国操纵，作出的决定往往代表美国为首的西方各国的利益。就是召开全体会议，美国也能左右表决机器。所以这个建议遭到苏联代表的拒绝。
1947年9月17日联合国大会终于顺利通过了美国关于朝鲜问题的提案。