隗嚣再遣张玄入河西，游说窦融与己联兵，共击冯异，将汉兵赶出关外，秦地 的安全就有保证。
窦融派弟窦友和刘均去洛阳，行至高平，获悉隗嚣反叛，道路阻绝，只好返回。 窦融又派司马席封择山间小路去洛阳。
窦融知隗嚣反，作书责之，曰：“伏惟将军国富政修，士兵怀附。亲遇瓦会之 际，国家不利之时，守节不回，承事本朝。后遣伯春，委身于国，无疑之诚，于斯 有效。融等所以欣服高义，愿从役于将军者，良为此也。而忿悁之间，改节易图， 君臣分争，上下接兵。委成功，造难就，去纵议，为横谋。百年累之，一朝毁之， 岂不惜乎？殆执事者贪功建谋，以至于此，融窃痛之。当今西州地势局迫，人兵离 散，易以辅人，难以自建。计若失路不反，闻道犹迷，不南合子阳，则北入文伯耳。 夫负虚文而易强御，恃远救而轻近敌，未见其利也。融闻：智者不危众以举事，仁 者不违义以要功。今以小敌大，于众何如！弃子徼功，于义何如！且，初事本朝， 稽首北面，忠臣节也；及遣伯春，垂涕相送，慈父恩也。俄而背之，谓吏士何？忍 而弃之，谓留子何？自起兵以来，转相攻击，城郭皆为邱墟，生人转于沟壑。今其 存者，非锋刃之余，则流亡之孤。迄今伤痍之耻未愈，哭泣之声尚闻。幸赖天运少 还，而将军复重其难。是使积痌不得遂瘳，幼孤将复流离。言之可为酸鼻。庸人且 犹不忍，况君者乎？融闻：为忠甚易，得宜实难。犹人太过，以德取怨。知且以言 获罪也。区区所献，唯将军省焉！”
隗嚣得书，不纳，窦融怒曰：“善言不入，是所谓下愚不移也！”乃与五郡太 守共厉兵马，上书请旨，欲出境击嚣。
梁统恐众心忧有疑虑，摇摆不定。为坚众心，遂杀张玄以示众。
吴汉、王常、刘歆、刘向入武关向北，将兵屯于长安城郊。吴汉令刘歆、刘向 统领兵马，自和王常入城汇冯异。
冯异和吴汉、王常商议，马上就要开兵见阵，攻打隗嚣，漆邑、汧城、栒邑都 是军事要地，不容有失。请吴汉、王常坐守长安，自己去栒邑，祭遵屯兵汧城，请 耿弇到后进漆邑。俟马武、盖延至长安后准备下一步的军事行动。
盖延、耿弇入武关后，欲主动寻找战机，率兵向西行，派人通知马武部，请其 西行相助。
盖延、耿弇两部汉兵一路向西，行至山区，二人因地理不熟，恐中埋伏，未敢 冒进。耿弇派苞梁带一支小分队探路，苞梁回来后道：“回将军，山中之路崎岖狭 窄，但穿过此山，地势开阔，山中无伏兵。”二将率兵进入山中。行了多时，苞梁 指指前面道：“前面是转弯处，转过这道弯，不过三五里。就可以出山了。”刚至 转弯处，突然，两侧山上军旗高举，帅字旗下，大将王元高叫：“本将军恭候多时 了！”随即巨木、圆石滚滚而下，汉兵队伍顿时散乱，纷纷后逃。王元指挥陇兵冲 下山来，汉兵溃退之中，死伤无数。此时马武已经进山，得知前面情况，命令就地 扎住阵脚，分兵立即占领两侧高处，自带亲兵一千，向前冲去。溃退的汉兵纷纷从 马武两侧而过，马武不见盖延、耿弇，知二人现在应在最后，加速快行。盖延、耿 弇等果然没及时撤出，被王元兵众包围。马武持枪一阵挑杀，冲透重围，将汉将们 救出。可王元率兵死死咬住追杀，马武大怒，率亲兵们向前杀去，方才将王元杀败。 汉兵退出山后，经清点，折去三千多人，苞梁也阵亡山中。
盖延、耿弇于山中被伏击战败的消息传入长安，冯异不敢耽搁，和祭遵出城而 去。祭遵自去汧城，冯异率部去栒邑，行至半路，得知隗嚣大将行巡率兵去攻打栒 邑，命令部队跑步前进。于匡道：“大将军，陇西兵众，乘胜而往，士气正高，不 可与之争锋。”邓晔道：“嚣兵获胜，纯属偶然，盖延若不西行，王元不过是狗咬 尿泡空欢喜。”冯异道：“虽属偶然，也有其必然性，战争时期，什么情况都有可 能发生，关乎成败的因素很多，稍有不慎，就可能打败仗，甚至满盘皆输。栒邑虽 小，关系重大，栒邑若失，则三辅动摇，直接威胁长安。必先抢先进驻栒邑，我方 安心。兵法云：‘攻者不足，守者有余。’其兵虽多，我则以逸待劳，此锋岂可不 争哉！”
行巡乃行武出身，做为大将，又自幼生长在陇地，自然知道栒邑的重要，一路 急行军赶到栒邑城下，却不料由于路途稍远，已然失了先机，冯异已先一步进入城 中。行巡见城上守城兵稀少，大喜，以为汉兵未至，下令攻城。栒邑守军知冯异蛰 伏城中，胆气倍增，拼命抵抗，战至天晚，行巡鸣金收兵。
半夜时分，冯异亲自率兵劫营。行巡毫无准备，汉兵一声呐喊，杀入行巡营中。 行巡无力抵抗，大败而逃，冯异率兵追杀数十里，大破之。
祭遵在汧城得盖延相助，大败王元。
陇西、北地震动，于是，北地豪长耿定等叛嚣归汉。
汉军大捷的消息传至洛阳，马援也奉诏回到帝都。
建武帝刚办完大傅卓茂的后事，任命邓禹为太傅。立即召见马援。马援献上游 说陇西大将，使之归汉的计策，建武帝大喜，马援原是隗嚣属下绥德将军，又是智 囊，对隗嚣集团可谓是知根知底，由他自往游说，必事半功倍。于是，拜马援太中 大夫，拨给五千骑兵，令其西行，并护送来歙至长安。颁诏曰：“制诏大司马、汉 忠、虎牙、建威、捕虏将军：虏兵猥下，三辅惊恐。栒邑危亡，在于旦夕。北地营 堡，按兵观望。今偏城获全，虏兵挫折，使耿定之属，复念君臣之义。征西功若丘 山，犹自以为不足。孟子反奔而殿亦何异哉？今遣太中大夫赐征西吏士死伤者医药、 棺敛，大司马以下亲吊死问候，以崇谦让。”紧接着，又颁了第二道诏书：“天水、 陇西、安定、北地各郡官吏、百姓被隗嚣诱入歧途者，三辅遭赤眉之难时，有犯不 道罪者，从殊死罪以下，皆赦免之。”
诏令征西大将军冯异进军义渠，斩断芦芳伸出的魔爪，并领北地太守事。
来歙、马援走后，窦融特使司马席封也历尽辛苦来到洛阳。建武帝嘉许窦融， 诏令右扶风修砌融父之墓。赐融汉宗室外属图及《太史公??五宗》，《外戚世家 》，《魏其侯列传》。并外方进贡之物。
建武帝为确保安东之国策顺利实施和发挥更大实效，颁诏曰：“设置官吏，所 以为人也。今百姓遭难，户口减少，而县官吏职所置尚繁，其令司隶、州牧各实所 部，省减吏员。县国不足置长吏可合并者，上大司徒、大司空二府。”
由是，合并减少四百余县，官吏职位减去十分之九。
冯异率汉兵开往义渠，青山渠帅肥头少卿知征西大将军前来，率部众万人降汉， 共同击败贾览，斩首千余级。于是，上郡、安定属汉。帝命冯异复领安定太守事。
马援游说嚣将间，高平第一守将、安定人高峻归降。来歙承制拜其为通路将军， 封关内侯。将军任禹也随马援降汉，马援又作书劝大将军杨广，杨广不答。
窦融发五郡兵马攻打隗嚣盟军先零羌封河，大败之，斩首千余级，得牛羊万头， 谷万斛。
建武帝知延岑出兵汉中，拜大司农李通为前将军，命率王霸、侯进打击延岑， 三战三捷，将延岑逼退。公孙述派兵来援，也被打败，延岑撤兵退出汉中。
建武六年十二年二十八日，建武帝下诏曰：“顷者师旅未解，用度不足，故行 十一之税；今军士屯田，粮储差积；其令郡国收见田租三十税一，如旧制。”
隗嚣认识到，反汉不过半年，战局便急转直下，汉兵胜王元、破行巡、收肥头 少卿、驱贾览、败封河、退延岑。马援又在后院放火，唆使大将判离，军心已经浮 动，使自己陷入极为不利的境地。于是定下主意，采取缓兵之计，上书建武帝谢罪 曰：“吏人闻大兵卒至，惊恐自救，臣嚣不能禁止。兵有大利，不敢废臣子之节， 亲自追还。昔虞舜事父，大杖则走，小杖则受、臣虽不敏，敢忘斯义？今臣之事， 在于本朝，赐死则死，加刑则刑，如更得洗心，死骨不朽。”
大臣们认为隗嚣推卸责任，粉饰祸心，语言激烈，冲撞圣君。眼见败亡在即， 乃行缓兵之计，岂是真心悔过！请旨诛杀其子隗恂。
帝知隗嚣玩的什么把戏，但只要有一线希望，仍打算不动兵而屈之。作书使来 歙派使至天水以复嚣。书曰：
“昔柴将军与韩信书云：‘陛下宽仁，诸侯虽有亡叛而后归，辄复位号，不诛 也。’嚣曾为文吏，晓义理，故复赐书。深言则似不逊，略言则事不决。今若束手， 复遣恂弟归阙庭者，则爵禄获全，有浩大之福矣。朕年垂四十，在兵中十岁，厌浮 语虚辞。即不欲，勿报。”
隗嚣见建武帝不但识破己计，紧跟着回了一计。自己将长子送入洛阳，早已万 分后悔，怎肯再将次子隗纯送入洛阳为人质。思来想去，以自己的实力是不足以抗 汉的，只好投公孙述做靠山，遂遣使向公孙述称臣。
建武七年三月，公孙述封隗嚣“朔宁王”。
五月，大司空宋弘免职，任命前将军李通为大司空，率本部回京。任命汉忠将 军王常为横野大将军。
秋天，隗嚣集三万马、步军攻安定，冯异率诸将于阴槃布阵阻击，隗嚣无法推 进。又遣别将下陇攻祭遵，冯异请来歙至汧城助之。
朝中大臣再次请帝诛隗恂，帝未应，打算率兵亲征，派使诏告窦融，命其率兵 东进，参加会战，剿灭隗嚣。却逢秋雨连绵，道路泥泞难行，西北洪水频发，桥断 路毁，无法开战，乃罢亲征。
窦融已率兵至姑藏。接诏退兵河西。
来歙奉帝诏，作书招降王遵。王遵，霸陵人，字子春，携家眷东归洛阳，帝拜 为太中大夫。
建武八年初，大年尚未过完，来歙、祭遵率兵欲攻打略阳。途中祭遵病重，由 军中郎中调理着，坚持前行。可天空中突然飘起了雪花，祭遵道：“来中郎，我记 得，去年八月十五，咱们是在雨中渡过的，这民谚说的好呀，八月十五云遮月，正 月十五雪打灯。今天不正好是正月十五吗？”来歙见祭遵骑在马上直打晃道：“还 真是，这就是经验之言，是百姓在生活中总结出来的。祭将军，我听你这咳嗽是越 来越重了，身体还行不？如不能坚持，先回去。”祭遵道：“本来就是去突袭，若 就此罢战，过完年战机就全失了。”来歙问郎中，郎中道：“体中生痰症，高烧一 时难退。”来歙意欲回兵，祭遵死活不干，来歙道：“将军病的这么重，无法指挥 战斗，况且主帅染恙，则会影响士气。”祭遵态度坚决，执意前行，来歙苦劝不住。 可雪越下越大，来歙道：“将军，你率大军回去，我只选两千精兵前往，可期一举 成功！”祭遵也实在无法再坚持，退回汧城。
来歙带着两千精兵，抬着云梯，避开大道，冒着暴雪，绕过番须、回中，神不 知，鬼不觉直抵略阳城下，突然攻入城中，杀死守将金梁，一举将略阳城占领。
来歙派人速回汧城，调一万兵马来守略阳，并报大司马、征西及横野等将。
隗嚣得知略阳已失，大惊失色道：“汉兵从何而至，竟有这般神速？来歙果有 大将之才也。”派王元据陇抵、行巡驻番须口、王孟堵鸡头山道、牛邯屯瓦亭，亲 率数万大军攻打略阳，誓要将略阳夺回。公孙述也派大将李育、田弇带兵相助。
捷报传到洛阳，建武帝龙颜大悦。众大臣不解，帝道：“来将军在西北数年， 又独具战略眼光，略阳虽小，却是心腹重镇，心腹已坏，肢体易解矣！”
又闻吴汉率大兵前去援助来歙，帝道：“去年洪水泛滥，收成大减，略阳城小， 屯粮不足，无法供应大军，番须、回中等地未收，通途受阻，不利于城外野战。略 阳城坚，一万余军守之可也，嚣久攻不克，方有隙可乘。命快马加鞭，换马不换人， 速将吴汉追回。”
却说隗嚣将略阳围住，四面攻打，搭云梯、筑土山，均无法攻克。来歙与将士 们固守城池已历时三月，拆屋断木以为兵器，所幸城中粮草未断，士气尚存。
四月，建武帝调岑彭入长安，着大司空李通监国，起大兵御驾亲征。光禄勋汝 南人郭宪拦驾谏曰：“东方初定，车驾未可远征。”帝不从。郭宪拔出佩刀将车靷 斩断，帝命卫士将其推开，大军一路西行。将到漆邑，由建威将军耿弇接入城中。 众大臣以王师之重，不宜涉远入险进谏。帝曰：“已入三辅之地，众卿不必复言。” 知马援也入漆邑城候见，招来问计。马援进言道：“陛下，隗嚣将士，已兆土崩， 王师一进，必破无疑。”说完，在帝前聚米为山，指画地势，详解途径，又言何处 可攻、何处可守、何处可伏。帝眼前一亮，大悟道：“虏已在朕目中了。”
窦融起五郡之兵，及小月氐骑兵、辎重五千余辆，再次进入姑藏。派使入漆邑， 请示拜见圣君之礼仪，帝闻而善之，起驾至高平，设酒会请融，并引百官相见，遍 犒三军。命大军分数路发起进攻，汉兵势如破竹，隗嚣兵败，退回天水，蜀将李育、 田弇退保上邽，略阳之围顿解。
建武帝进入略阳城中，大排盛宴，犒劳将士。为彰来歙首功，赐坐特席，位居 诸将之首。又赐来歙之妻缣千匹，封窦融安丰侯，食邑四县。窦友为显亲侯；武威 太守梁统为成义侯；酒泉太守竺曾为助义侯；张掖太守史苞为褒义侯；金城太守库 均为辅义侯；敦煌太守辛彤为扶义侯。
众臣谢恩毕，窦融以久专方面辖制五郡，手握重兵自是惴惴不安，恳请帝另择 贤臣镇守凉州，愿随驾从征。帝曰：“朕与将军，如左右手耳！执辞谦退，何不晓 朕意！勉循士民，无擅离部曲。”命其率部回河西，窦融拜辞而去。
太中大夫王遵，自应来歙之劝弃隗嚣归汉后，深得信用。王遵与牛邯甚厚，知 隗嚣不久见灭，恐祸及好友，乃作书至瓦亭劝说牛邯，书曰：“遵与隗嚣歃盟为汉， 自经历虎口，践履死地，已十数矣。于是周洛以西，无所统一，故为王策，欲东收 关中，北取上郡，进以奉天人之用，退以惩外夷之乱，数年之间，冀圣汉复存，当 挈河陇奉旧都以归本朝。生民以来，臣人之势，未有便于此时者也。而嚣之将吏， 群居穴处徒，人人抵掌，欲为不善之计。遵与孺卿日夜所争，害己及身者，岂一事 哉！前计抑绝，后策不从，所以呤啸扼腕，垂涕登车，幸蒙封拜，得延议论，每及 西州之事，未尝敢忘孺卿之言。今车驾大众，已在道路，吴、耿骁将，云集四境， 而孺卿以奔离之卒，拒要厄，当军冲，视其形势何如哉？夫智者睹危思变，贤者泥 而不浑，是以功名终申，策画复得。故管仲束缚而相齐，黥布仗剑以归汉，去愚就 义，功名并著。今孺卿当成败之际，遇严兵之锋，可为怖慄。宜断之心胸，参之有 识，毋使古人得专美于前，则功成名立，在此时矣。幸孺卿图之！”
牛邯得书，徘徊数日，觉得西州不过一隅，终是难御强汉，子春之言，实乃善 语，于是降汉。帝亦拜为太中大夫。
牛邯归汉，嚣营震动。于是，大将十三人、属县十六、兵卒十万叛嚣归汉。
隗嚣大恐，急派王元入蜀求助，自携众离天水奔西城，入大将军杨广军中。
建武帝诏告隗嚣：“若束手自诣，父子相见，保无他也。高皇帝曰：‘横来， 大者王，小者侯。’若遂欲为黥布者，亦自任也。”
隗嚣终是不降，于是，帝降诏驰回洛阳，诛隗恂。
命大司马吴汉、征南大将军岑彭攻西城，虎牙大将军盖延、建威大将军耿弇攻 上邽。
时间如白驹过隙，匆匆逝去，转眼间进入八月。大司空李通使快马飞报：“颍 川盗贼复聚，略乡攻县，河东郡守军叛乱，京师骚动，恳请回銮靖寇。”建武帝不 禁叹息曰：“悔不听郭子横之言。以至有此乱，朕意返回安东。”执金吾寇恂进言 ：“颍川百姓素有从众跟风之俗，知陛下涉远伐陇，受妖者蛊惑而聚，此处征伐， 正处紧要之时，圣上未可东归，臣愿披坚执锐前去讨伐。”帝曰：“东方平定时短， 尚未稳定，颍川、东郡迫近帝都，如不及时戡乱，其势则会蔓延，其危更甚于陇蜀。” 下诏与大司马：“朕东归平叛，两城若下，卿可将兵南击蜀虏。人苦不知足，即平 陇，复望蜀。每一发兵，头发为白。”
建武帝命王常随驾返回。寇恂请为先锋，帝命寇恂：“直指颍川。”
寇恂来到颍川，贼首知御驾亲征，寇恂来至，知无可免，率众伏地而降。寇恂 奉诏惩其首恶，赦免从众。颍川百姓又恢复了往日的平静，待御驾也来到颍川，百 姓扶老携幼，跪拦圣驾，众声一致道：“恳请陛下，复借寇君一年！”建武帝思忖 ：再有一年时间，东方就会基本稳定了。于是对寇恂道：“颍川地近京师，安定尚 需时日，今百姓请留爱卿，可卿刚任九卿，又要还归地方，望卿以国事为重。”
建武帝将寇恂留长社县，镇抚吏民，起驾还京。
派大司空李通、横野大将军王常率兵开往东郡，征剿叛军。考虑到寇恂曾任颍 川太守，寇恂前往颍川，收到奇效。耿纯也曾任东郡太守，在任四载口碑不错，现 免官在京，不如仿颍川事。于是拜耿纯为太中大夫，随军前往。
东郡吏民闻耿纯至，竞相来迎。贼众闻之，九千余人至军前弃戈跪降，大军不 战而返。李通、王常将当时的情景奏报，帝下诏，任耿纯为东郡太守。
建武帝考虑在陇西作战的各部队，如果不能尽快剿灭隗嚣，平息陇地，必会受 到军粮不足之困。现在看来，战争不会一时半刻间结束。于是下诏：“吴、冯、岑、 祭、盖、耿及诸将，诸郡甲卒但坐费粮食，若有逃亡，则沮败众心，宜遣老羸之卒， 留精壮之士，以利攻伐。”