人们最担心的事终于发生了。
康熙十二年（1673年）十一月二十一日清晨，吴三桂召集四镇十营总兵马宝、高起隆、刘之复、张足法、王会、王屏藩及胡国柱、吴应期、郭壮图等各将官赴王府会议。云南巡抚朱国治率所属官吏奉命而来。三桂全身戎装，威坐殿上，正式宣布起兵，与朝廷决裂。他当场勒令朱国治投降，遭到断然拒绝。三桂下令把朱国治和不降的官员全部逮捕，其中包括云南按察使司按察使李兴元、云南知府高显辰、云南同知刘昆等一大批官员都先后被捕，看押起来。三桂派人传令，不得随意妄杀。命令到时，胡国柱率兵已将朱国治乱刀砍死，身首异处。当年，苏州有一民谣：“天呀天，圣叹杀头真是冤，今年圣叹国治杀，明年国治又被国柱歼”。《平滇始末》。民谣反映了当地百姓对朱国治枉杀金圣叹的痛恨之情，却不幸被言中。此时，他自己真的被“歼”，死于与他的名字相谐音的“国柱”之手！
三桂为收揽人心，不想开杀戒，虽然他痛恨朱国治，也想留他一命，慢慢劝降。既然部下已将他杀了，也无须追究。他们杀死了朱国治后，正要对李兴元、刘昆等官员下手，一接到命令，这才停止。过了一会儿，胡国柱出面，让兵士给各官员松绑，命他们照旧供职。李兴元、高显辰、刘昆等坚持不降，被看押起来。圣祖的钦差折尔肯、傅达礼等被拘留软禁。
三桂的妻子张氏得知丈夫谋反的消息，急上殿。大哭大闹，指着她的女婿、侄儿们说：“朝廷有什么对不住你们的？你们竟敢闹出这种事来！”又冲着三桂说：“这不是要害死我的儿子吗？”她指的是应熊还在北京，这边谋反，朝廷能不要她儿子的命吗？三桂不为所动，叫他的女婿郭壮图等人赶快把她扶进后宫。她哭哭啼啼，被强行架走了。
处置完朱国治等一批抗拒从叛的官员，三桂宣布，他自这天起，称“天下都招讨兵马大元帅”，建国号“周”，以明年为周元年。
接着，三桂选择吉日，率三军拜谒永历帝陵，誓师北伐。事先，他召集诸将，说：“拜别已故君主，应当穿故君时的衣服见他。”他指着自己的头说：“我先朝曾有此帽子吗？”又指指自己身上的衣服，说：“我先朝曾有此衣服吗？我这老臣将易服祭故君，你们自己考虑该不该易服。”诸将都表示易服。
清朝自关外建国伊始，就确立一项政策，凡从明朝俘获或投降过来的汉族百姓，汉官汉将都必须剃发易服，改穿满族服饰，否则，就是不遵国体，对清朝（后金）不忠，视为大逆不道，罪不容诛。入关后，直至亡国，一直把它作为国策，贯彻始终。在明朝看来，凡已剃发易服的汉人，就是叛逆，视为敌人。三桂去满装，改穿汉服，重新蓄发，标志着他同清朝的彻底决裂，是对清朝的背叛。
三桂说通了诸将，择日下令，三军都改穿汉服，蓄留头发，一如明朝装饰。三桂头戴方巾，身穿素服，在永历陵前，亲自酹酒，三呼再拜，恸哭不止，趴在地上不起来，大放悲声。具有讽刺意味的是，永历帝是他擒获的，又是他下令秘密处死的，十余年后的今天，此时此刻，他却拜倒在永历陵前，痛哭流涕，究竟悲从何来？与其说哭永历帝，倒不如说哭他自己更符合实际。他为什么不哭自己呢？他为清朝奋斗了大半生，以牺牲千百万明人和农民军的生命，换取了一顶王冠，获得一方土地，希图永镇，世享福贵。谁想朝廷撤藩，打碎了他的迷梦，他将失去所得到的一切，两手空空地回到那荒凉的关外，了此残生。而且，到那时，命运如何，谁又能敢保他及子孙平安无事呢？他想到这些，心里怎能好受！在那数行热泪中包含了他多少愤激、不平和悲叹、后悔的情绪！三桂的这番举动，是对他降清后所作所为的自我否定。人往往在遭到重大挫折或失败时，才反躬自省，发现自己的不足或错误。三桂的前程由于撤藩而毁弃，实为他一生中重大挫折，这才“觉今是而昨非”，否定自己的过去，重新缔造未来。因此，他弃以往之非，跪倒在自己杀害的永历帝的神位面前，一种忏悔的正义感在他心中不断升华，良心得以重新发现，他感到自己变得神圣、思想纯正，已从“邪恶”中摆脱出来，偿还了欠下永历的血债。于是，眼泪从心底涌出，无法抑止。哭吧，让眼泪洗刷掉自己的耻辱！
也许哭得过于悲痛，三桂的悲声牵动了三军的民族情感，他们只想到朝廷不守信义，剥夺了他们已得到的东西，对朝廷的愤恨——满人压制汉人，占据了他们的心头，谁还去想永历帝死于谁手？偶尔想到，自然得归罪于满人的清朝。所以，三桂一哭，三军同哭，“声震如雷，人怀异志”，惟有听命于他们的统帅吴三桂，去重新开辟自己的锦绣前程！
三桂哭陵，是对他的广大将士的思想动员和誓师，激励他们跟随他去同清朝决战决胜。第二天，他又下令三军赴昆明郊外校场阅兵、较射，从军事上再动员。约定：不按时到场的，必以军法从事。
次日，天刚亮，鼓角齐鸣，各镇将士整队入场，军容肃然。三桂全身披甲，飞身上马，扬鞭疾驰，手发三矢，皆中目标。三军为之欢呼雷动。演习完射箭，再演练各种武器。校场正面两侧摆列着大剑、画戟、雕戈等长短格斗兵器。三桂每驰马一回，即驰至武器处，由侍卫飞递一兵器，他在马上稳稳接住，然后策马疾驰，挥动兵器，如搏战进击，运用自如，恰似“风驰雨骤，英武绝人”。三桂以62岁的高龄，在飞驰的马上精彩地表演了射箭和各种长短兵器，武艺娴熟，技法高超，威风不减当年！三军看得发呆，不时爆发出欢呼声。三桂就是要让他的广大将士亲眼目睹他的雄风，他要使他们相信，虽然他已进入老年，仍然有能力率领他们去夺取新的胜利。他要给他们以信心和勇气，藐视清朝，驱除他们对清朝的迷信和畏惧心理。三桂的目的达到了，他为此感到欣慰。以上关于三桂哭陵、校场演武诸事，皆取自《四王合传·吴三桂传》。需要考察的是，该书把此事都记在三桂宣布叛清前发生的，这不符合情理。三桂叛清前，一切准备活动都是秘密进行的，如此大规模的易服祭陵、演武只能是在公开宣布叛清时搞的。
三桂欲师出有名，先声夺人，特精心制作一道讨伐清朝的檄文，全文如下：
原镇守山海关总兵官、今奉旨总统天下水陆大师兴明讨虏大将军吴，檄告天下文武官吏军民人等知悉：
本镇深叨明朝世爵，统镇山海关。一时李逆倡乱，聚贼百万，横行天下，旋寇京师，痛哉毅皇烈后之崩摧，惨矣！东宫定藩之颠踣，文武瓦解，六宫恣乱，宗庙瞬息丘墟，生灵流离涂炭，臣民侧目，莫可谁何。普天之下，竟无仗义兴师勤王讨贼，伤哉！国运夫曷可言？
本镇独居关外，矢尽兵穷，泪干有血，心痛无声，不得已歃血订盟，许虏藩封，暂借夷兵十万，身为前驱，斩将入关，李贼逃遁，痛心君父，重仇冤不共戴，誓必亲擒贼帅，斩首太庙，以谢先帝之灵。幸而贼遁冰消，渠魁授首，政（正）欲择立嗣君，更承宗社封藩，割地以谢夷人。不意狡虏遂再逆天背盟，乘我内虚，雄踞燕都，窃我先朝神器，变我中国冠裳，方知拒虎进狼之非，莫挽抱薪救火之悮（误）。本镇刺心呕血，追悔无及，将欲反戈北逐，扫荡腥气，适值周、田二皇亲，密会太监王奉抱先皇三太子，年甫三岁，刺股为记，寄命托孤，宗社是赖。姑饮泣隐忍，未敢轻举，以故避居穷壤，养晦待时，选将练兵，密图恢复，枕戈听漏，束马瞻星，磨砺竞惕者，盖三十年矣！
兹彼夷君无道，奸邪高张；道义之儒，悉处下辽（僚），斗筲之辈，咸居显职。君昏臣暗，吏酷官贪，水惨山悲，妇号子泣，以至彗星流陨，天怨于上；山崩土震，地怨于下；官卖爵，仕怨于朝；苟政横征，民怨于乡；关税重征，商怨于涂；徭役频兴，工怨于肆。
本镇仰观俯察，正当伐暴救民，顺天应人之日也。爰率文武臣工，共勷义举，卜取甲寅年正月元旦寅刻，推奉三太子，郊天祭地，恭登大宝，建元周启，檄示布闻，告庙兴师，刻期进发。移会总统兵马上将耿（精忠）、招讨大将军总统使世子郑（经），调集水陆官兵三百六十万员，直捣燕山。长驱潞水，出铜驼于荆棘，奠玉灼于金汤，义旗一举，响应万方，大快臣民之心，共雪天人之愤。振我神武，剪彼氛，宏启中兴之略；踊跃风雷，建划万全之策，啸歌雨露；倘能洞悉时宜，望风归顺，则草木不损，鸡犬无惊；敢有背顺从逆，恋目前之私恩，忘中原之故主，据险扼隘，抗我王师，即督铁骑，亲征蹈巢覆穴，老稚不留，男女皆诛；若有生儒，精谙兵法，奋拔谷，不妨献策军前，以佐股肱，自当星材优擢，无靳高爵厚封，其各省官员，果有洁己爱民、清廉素著者，仍单仕；所催征粮谷，封贮仓库，印信册籍，赉解军前。其有未尽事，宜另颁条约，各宜凛遵告诫，毋致血染刀头，本镇幸甚，天下幸甚！《华夷变态》，卷2，53~54页。该书卷2，80~82页，收录了三桂又一道檄文，可资参照。两相比较，两道檄文内容大体相类，惟文字有差异，个别事实亦有不同。
吴三桂的这篇“讨清”檄文，论文采虽比不上骆宾王的名篇《讨武曌檄》见《古文观止》（上）。，却也大有气贯长虹之概，不失为名士精心之作。如从内容上考察，此文多有不实之词，巧饰伪装，随处可见，且回避要害，掩天下人耳目。檄文开头一大段，以当年“讨贼”自任，历数复君父之仇的盖世之功，向天下人自我夸耀。可是，他当时骑墙山海关，首鼠两端，对一度降李自成一事避而不提。此其一。
他大书不得已借清兵复仇之苦衷，并以最终灭掉李自成而自诩，这也确是事实，但却掩饰了自己完全降清的真相。声称他委曲求全，“养晦待时，选将练兵，密图恢复”明朝已有三十年，云云。可是，他无法解释这三十年他为清朝效命疆场，剿灭农民军，扫荡南明，尤其是擒杀永历帝等血的事实。他坐镇云南，希图永镇，千方百计保存自己的权势与地位，何曾为恢复明朝而做什么准备！因此，对这些事，他只好避而不书一字！他叛明降清，这是不容篡改的历史，无论时人和今人，有谁能质疑呢？即使有人为之辩解，不过是嘲弄历史，徒劳无益！此其二。
檄文声称，当年他曾奉三太子，欲恢复明朝。三太子何曾到过他手？这是从来没有的事！根本谈不上奉三太子入都即位。此事显系三桂伪造，不足为据。如今，已过去三十年，忽然又冒出一个“三太子”，要“恭登大宝”了，这又是弥天大谎！他自己的行为，自称周王，自立年号，就使自己的谎言不攻自破！此其三。
檄文声讨清朝罪行，说得如此吓人，却是夸大之词。清入关后，废除了明朝一些苛政，采取了恢复生产的措施，特别是到圣祖亲政后，整个形势日见好转，不像三桂说的，如天怨、地怨，仕、民、商、工皆“怨”，还未达到这种程度。此其四。
檄文的最后一段，极力渲染他兵多将广，势力之大，有气吞中华之概，以此动员人们响应和支持他的行动。他规定数项政策，目的是争取同情者，吓唬那些拥护清朝的人。仅此而已。
檄文表述了三桂的目标，是要推翻清朝的统治，建立一代新王朝。但看起来，好像是三桂的自白书，或叫做自我“辩解书”。如果我们不加分析地全部相信他所说的话，那就错了，可能会把我们的认识引向歧途！
奇怪的是，三桂的这道檄文，不见诸任何清官方或私人著述。在官方书中只说三桂“伪檄”四处传布，对其中内容不及一字。这证明三桂当时确实发布过檄文。为何置而不书？细想起来，也不难理解。檄文毕竟触及了当年三桂与多尔衮订盟等事实，清圣祖和他的廷臣们也不敢做出回答；尤其是檄文无处不痛骂清朝，这对清朝是不光彩的，如刊于官方史书，倒是替三桂做了宣传。因此宁可不保留一字，勿使其传世。至于私家著述，为避讳也不敢刊登此文。这可能就是檄文在清代文献中失载的原因吧！
三桂的檄文，是他叛清、抗清的宣言书。为动员全国汉人反清，他大量复印檄文，派人奔赴各地传送，他亲自致书平南、靖南两王，并向贵州、四川、湖南、陕西等省跟他有关系的将官去信，动员他们起兵响应。
云南是三桂直接控制下的努力范围，省城昆明是他的“栖息”之地，他的心腹和党羽分布各要津，他一声令下，全省与昆明同声听命。朝廷命官、地方官吏大多投降应叛，像云南提督张国柱、永北总兵官杜辉、鹤庆总兵柯泽、布政使崔之瑛、提学道国昌等等一大批汉官汉将都响应了三桂的叛清号令，接受三桂的职务。《逆臣传·吴三桂传》，卷1，14页；《逆臣传·张国柱传》，卷2，2~3页。只有少数官吏，如按察使李兴元、云南知府高显辰、同知刘昆抗拒不从。三桂本意，并不想杀死他们。责令胡国柱把他们押送到“审事堂”。刘昆斥责说：“要死就死，有何事可审！”国柱笑着说：“需等待命令。”说着，很客气地给他们座位坐下。李兴元慷慨激昂，骂不绝口，痛斥三桂：“你内为国戚，外封亲王，受恩最重，为什么要背叛朝廷？我为丈夫，义可杀，不可辱，惟有一死报朝廷！”《清史稿·李兴元传》，卷253，9734页。三桂的刑曹官杨彦光上前劝道：“您不必如此，且等刘先生（指刘茂遐）一言。”另一刑曹官傅奇栋接着说：“您与旗员不同，您是明朝世家，今日正要恢复明朝，您应该效力。”
刘昆驳斥说：“你说的完全错误。顺治元年，吴三桂等辈迎王师入关，至十八年，又于缅甸擒永历。前明之亡，是谁干的？在明朝，亡明朝；事清朝，叛清朝，是两朝乱贼，天地不容！我恨力不能杀你们，还想污辱我这七尺之躯吗！”
刘昆等三人至死不屈，审问他们的人非常痛恨，又无可奈何，只得转告三桂，下令查抄刘昆的公署衙门，除了图书外，只有两件衣服、米二石、钱三千文，马一匹，夫役二人，余无他物。三桂转恨为钦佩，怒责左右人：“你们平日总说他贪，今‘贪’如此！几乎被你们误了事。”对胡国柱说：“刘某清廉能干，我行大事，不可无此人。你们替我劝降他。”半夜，三桂派人来到审事堂，转达了他的愿望。刘昆怒斥来使，来使说：“如不从，将有杀身之祸。”刘昆怒目圆睁，厉声斥责，操起铁索向来使掷去。来使不得已，急忙回去复命。三桂不禁发怒：“难道真倔强如此吗？”指示国柱说：“要给他特殊的苦头，再降他！”十一月二十七日，给刘昆上了刑具，押送到三市街，与高显辰一起，各杖四十，然后把高显辰发往永昌卫、刘昆发往云南西部边远的腾冲卫充军。这两地多烟，让他们备尝苦头，将李兴元投入监狱《庭闻录》，卷5，1~2页。，不久，他服毒自杀身死《逆臣传·吴三桂传》，卷1，14页。又，《清史稿·李兴元传》，卷253则载：兴元被三桂孙子世璠刺杀于狱中。。
三桂毫不费力地消除了“亲情”派的微不足道的反抗，云南迅速成了他的一统天下。他公开打出了独立的旗号，立即准备出师战斗。他迅速着手组织他的军队，重新建制，部署兵力，选将命官，使之适应即将开始而又不可避免的军事斗争。
按照三桂的意图，设金吾前后左右四将军，为各军的首领，其次设左右两翼将军，以下设左右两掖将军、铁骑前后左右将军、骁骑前后左右将军；命名奋威、仁威、亲威、建威、龙威、绥远、怀远、广武、勇略等将军。其下便是各路总管，设征朔、讨朔、覆朔、灭朔、殄朔、破朔、剿朔、靖朔八大将军。各级将领均以“将军”称之，在“将军”之前冠以各种响亮、富有征战意味的名号。所设“征朔”八大将军，都加一“朔”字，是对起自东北的满人的蔑称，前冠以征、灭、殄、覆、破、剿、讨、靖八个字，都是彻底消灭清朝的意思。从这些新起的名号，都可窥见三桂誓与清朝血战到底、“汉贼不两立”的决心。
三桂按此名号分封他的将领：封郭壮图为留守云南路总管，料理核查云南府属印信，催征银两，保证军饷的供给。以胡国柱为金吾左将军，夏国相为金吾右将军，吴国贵为金吾前将军，吴应期为金吾后将军；马宝为铁骑总管将军；以上见《平吴录》，7页。王屏藩、卫朴为骠骑前后将军；陶继志、张足法为骠骑左右将军；王会、高启隆为骁骑左右将军；线维明、田进学为铁骑前后将军；范齐韩、廖进中为铁骑左右将军。《庭闻录》，卷5，2页。按，三桂所设职官与“将军”，各书略有差异，今参酌各书记之。
任命各部职官：以方光琛为吏曹、来度为户曹、钱点为礼曹、韩大任为兵曹、冯苏为刑曹、吕忝子为土曹。以郭昌为云南巡抚。三桂所设“六曹”，亦即清廷的“六部”。显然，三桂开始仿照清制来建设他的新政权。他采取的一系列组织措施，就把他所掌握的军政力量都组织到一个政权之内，形成了上下相维的比较严密的整体。
康熙十二年十二月初一日，三桂自云南发兵北伐，向清朝展开了战略进攻。军队所使用的战旗皆用白色，步骑兵头戴用白毡做的帽子，表示为永历挂孝，不忘明朝旧恩。《逆臣传·吴三桂传》，卷1，14页。三桂派吴国贵、夏国相率步骑为前驱，兵锋直指贵州。他自率马宝等诸将随后进发。在此之前，三桂已派王屏藩率部独取四川、陕西。三桂很信任他，说：“王屏藩前去取四川，如同我去。”马宝请求自任两广方面的军事，率部取两广。三桂说：“两广只须一辩士口舌可下，不烦派兵，我已派人前去游说。”《平滇始末》，3页。
由圣祖撤藩引起、三桂发动的大规模内战由此而爆发。刚刚安定的局面又陷入新的大混乱，广大人民重新被打入战争的火海之中，不断遭到流血牺牲。现在来讨论撤藩的后果及其政策是否得当，为时尚早。还是随着战局的发展和它对全国局势的影响，我们才能更深刻地认识到三桂反叛的深刻的社会根源，判断出这场战争的性质与是非。