尽管那些日本战犯和他们的辩护律师尽了最大的力量做了辩护；尽管他们想方设法拖延时间，期待世界形势出现变局，让审判不了了之，但是，远东国际军事法庭的审判还是一步步走向了终点。随着1948年春天的到来，这些战犯的最终命运也越来越引人关注。
◆ 争写判决书
1948年4月13日，在远东国际军事法庭即将结审时，日本《朝日新闻》在头版头条意外地登载了一篇美联社记者莫里斯·哈里斯对25名被告量刑的预测消息，顿时轰动全球。据哈里斯预测，死刑在25人中约占半数，监禁刑约为10人，无罪1至3人。哈里斯认为，其中制造“南京大屠杀”的松井石根将不会被判处死刑。看到这一预测，清濑一郎等日本辩护律师们急忙跑到盟军国际检察局去交涉，认为这则消息会使人产生先入为主的印象。美国律师也跟着起哄。
这条预测同样让中国代表们十分担忧。
1948年4月16日下午5点11分，在检察方面做了最后陈述并向法庭求刑之后，长达两年的审理就此结束了。日本战犯被押回巢鸭监狱，等待法庭对他们做出最后判决。由11个战胜国所组成的法庭随即展开秘密讨论，书写二战日本历史的终结篇，并决定日本战犯的命运。
按照事先预定的程序，远东国际军事法庭进入对28名日本甲级战犯起草判决书的阶段。当时，有人曾主张判决书统一书写，但中国法官梅汝璈认为，日本对中国的武装侵略，最远可从1874年武装侵略中国领土台湾算起，直到1945年8月无条件投降为止，历时达半个多世纪。有关日本军国主义侵华罪行的部分，中国人受害最深，中国人最明白自己的痛苦，中国人最有发言权，因此，法庭判决书中有关中国的部分理当由中国人自己书写。
经过梅汝璈的积极争取，经过法官们的讨论，判决书最终确定为10章。其中对中国的侵略部分单独列为一章。
作为来自中国的法官，梅汝璈理所当然负责判决书《日本对华侵略》的起草工作。判决书写得如何，将直接影响到最终的判决结果。
面对法庭两年来的审判，证据证言堆积如山，为了尽快完成工作，梅汝璈和他的两个助手夜以继日，竭尽全力，在长达三百页的初稿上倾注了大量心血。事后，梅汝璈曾经回忆说，那些日子，他们就像钻进成千上万件证据和国际法典中的虫子，每天在上面爬来爬去，生怕遗漏了重要的东西。
中国法官用了一个月的时间，向法庭提交了长达两百多页的判决书章节。在这次历史性审判形成的长达90余万字的国际刑事判决书上，留下了梅汝璈代表4亿多受害中国同胞写下的10多万字。这是所有判决书中撰写得最快的一份。梅汝璈撰写的部分很快就获得法官会议的通过。
◆ 战犯量刑纷争四起
在这之后，法官就将面临他们使命中最重大、也是最重要的工作，给所有被告量刑。也就是说，根据被告所犯罪行的大小轻重，决定究竟是让他们死，还是生？
在法庭审理结束三天后，国民政府外交部就已发给梅汝璈法官一封“东字１１０３号密电”。密电指示梅汝璈要代表中国政府要求对土肥原贤二、坂垣征四郎等９名侵华主犯“应从严惩治”。与此同时，中国国内舆论也对远东国际军事法庭马拉松式的审判极为不满，纷纷致电、写信给外交部或梅汝璈，强烈要求迅速结束审判，严惩战犯。
梅汝璈面临着巨大压力。
由于对国际法律的不同理解和受各国不同法律体系的影响，11国法官间意见分歧很大，并且逐渐出现对立情绪，特别是在对东条英机等25名战犯是否应该判处绞刑的问题上发生了激烈争执，来自本国已废除死刑且未遭到日军过多侵略践踏国家的法官们不赞成用死刑。
尽管欧洲的纽伦堡国际军事法庭早已终结，12个纳粹德国的战犯被判处绞刑，除戈林畏罪自杀以外，其余11人均被执行。
但在远东国际军事法庭的法官中间，对战犯的量刑却纷争四起，莫衷一是。法官们各自援引本国的法律条款，各自坚持着自己的主张，互不相让。这也难怪，远东国际军事法庭制定了必须共同遵守的《宪章》和诉讼程序，却没有一个共同的量刑依据。
印度法官从一开始就认为，国家行为不应追究个人责任，因此他主张无罪开释全部日本战犯，而且他的理由是：“世人需以宽宏、谅解、慈悲为怀，不应该用正义的名义来实施报复。”美国法官克莱墨尔也坚决表示反对采用死刑，但他的注意力紧紧盯在那些发动太平洋战争和虐待美军战俘的战犯身上。
卫勃庭长颇感为难，于是提出了一个非常古怪而可笑的办法：“将这些战犯统统流放到太平洋中某一荒无人烟的孤岛上去，就像当年拿破仑战败被流放那样，也算是对战犯的一种惩罚！”一些已废除死刑国家的法官和没有遭受日本荼毒国家的法官表示赞同。苏联军事法官柴扬诺夫将军反对。中国法官梅汝璈也据理力争说：“如不能依法严厉制裁日本战犯，既有悖于本法庭的宗旨，又违背《波茨坦公告》之精神。”他坚决要求严惩土肥原贤二、坂垣征四郎和松井石根等人。
从每个法官的态度中不难看出，力主死刑的是少数派。
为此，在法官会议后，梅汝璈专门来到卫勃庭长的办公室，就法庭严惩日本战犯之事，再次和他磋商。但商量了许久，卫勃庭长仍难改初衷。梅汝璈激动地说道：“审判长先生，我和我的同伴，都是受四万万五千万国人的委托，来此惩罚元凶祸首的。如远东国际军事法庭不能做出令人信服的判决，我等都无颜再见江东父老，惟有集体蹈海一死，方能以谢国人！”“什么？！”卫勃庭长吃惊地瞪大了眼睛。“当然，个人之颜面、生死均是小事。千百万同胞的血债必须讨还。请审判长考虑我们的这一最后请求！”卫勃庭长被梅汝璈真挚的情感深深感动了：“我个人的意见可以收回，只是其他法官……”梅汝璈表示，自己将与其他各国同仁商谈。