庭长卫勃在一片相机快门的按动声里致开庭词。他语调平稳柔和地说：“在来到这里之前，各位法官签署了一份宣誓书，要无所畏惧地、不受外界影响地进行审判。我们完全了解我们担负的重大责任，历史上没有哪一次审判比这次审判更为重要。”“被控所犯罪行包括破坏世界和平罪、破坏战争公法罪、反人道罪和共同谋划罪。由于所犯罪行不胜枚举，且情节极为严重，特决定成立国际军事法庭进行审判。”
根据《法庭宪章》规定，审判程序是这样安排的：首先由代表盟国起诉方的检察官宣读起诉书，然后作认罪传讯。之后，法庭进入正式庭审。庭审分为4个阶段：
第一阶段，检察方面起诉，提出证据，对质；
第二阶段，被告辩护方面辩护，提出反证，对质；
第三阶段，检察方和辩护方相互辩论；
第四阶段，检察方面进行最后陈述和请求法庭量刑。
辩护方申诉结束后，法庭就进入最后阶段，由法官闭庭进行内部讨论，起草判决书，量刑，最后是宣判。这是典型的英美法系审判程序，充分照顾了被告的权利。此外，审判还规定，每一个被审讯的战犯除设有自聘的日本律师及辩护人外，还要配置一名美国律师。后来，这些美国律师为一些没有危害美国利益的战犯“寻机开脱”，成为东京审判顺利进行的一大障碍，严重影响了审判的进度。
卫勃庭长读完开庭词，首席检察官季南向法庭介绍了各国检察官，接着他请求法庭允许他开始宣读起诉书。起诉书长达42页。有记者记下了聆听起诉书时东条英机的神情：他“表情凝固，昂着头”，“拿出手帕，擤鼻涕的声音甚至连记者席也听得到。”
让谁都没有想到的是，就在宣读起诉书的时候，法庭突然出事了。坐在被告席最上面一排的大川周明突然伸手照着坐在他前面的东条英机的秃头就是一巴掌。他拍打的声音很大，表情僵硬的东条回过头去，咧着嘴苦笑了一下。法庭里的人都笑了。这个戏剧性的场面来得太突然，法庭里所有人的目光全都集中到了被告席的上面。反应敏捷的摄影师迅速捕捉到了这个画面。
大川周明是日本法西斯文人中最狂妄的宣传家和煽动家，狂热的军国主义和扩张主义分子，他在日本法西斯运动和侵略扩张活动中是个重要角色。他曾经杜撰神话说：“既然某些历史学家认为日本是我们这个星球上建立的第一个国家，那么它的使命就是统治所有的民族。”他还是“大东亚共荣圈”理论的鼓吹者，为日本军国主义侵略中国制造舆论，被人称为日本的戈培尔，绰号“大东亚雄辩家”。
当时，有一位美国记者对大川作了下列评价：“大川是个狂热分子、冒险家、典型的恶棍，满脑子帝国伟大之幻想。他在满洲和中国内地当过大商务机构的代表，他把这种工作同那种旨在改变日本政治体制的残暴血腥阴谋结合在一起。大川既是一个厌世绝欲的人，又是个奢侈享乐之徒；他既是一个有才能的狂人，又是一个强有力的人物。他和东条英机、木户幸一都陶醉于成功、沽名钓誉的行动计划，都喜欢被人奉承为‘大日本’的缔造者。”
大川周明在日本投降后，据说受了刺激，精神变得恍恍惚惚。在5月3日上午开庭前，大川周明的辩护律师向法庭提出申请，认为他目前的精神状况不适于接受审判，请求做精神鉴定。但这个申请被法庭驳回了。
其实，大川周明刚被押入法庭时就引起了众人的注意。他的个头在日本人中间属于高个子，他长得瘦削，却又穿了件宽大的破西服，这使他显得更高更瘦。令人可笑的是，他身着西服，脚上却蹬了一双日本式木屐，走起路来“吱嘎吱嘎”不停地响，使全场人都对此格外注目。
法庭宪兵见此情状，上前命令大川周明脱掉木屐，大川周明顺从地脱去了木屐，可是他的动作没有停顿，竟又把身上的西服也脱下来，上身只剩下一件皱皱巴巴的衬衣。他将衣领敞开，露出了细长的脖颈，他的喉结上下不停地鼓动着。他这副模样使熟识他的人忍俊不禁。因为过去的大川周明可是个仪表堂堂、文质彬彬的人。
大川周明在法庭上茫然四顾，似乎不知道干什么好。过了一会儿，大川周明的身子在座椅上开始扭动。他解开上衣所有的扣子，用手不停地搔挠他那凹陷的胸脯，像在抓捉身上的虱子。
法庭庭长卫勃发现大川周明这番举动后，命令看守人员给大川穿好衬衣。站在大川身后的美国宪兵立即执行命令，将衬衣重新套在大川的身上。
但是不一会儿，大川周明又将身上的衬衣脱了，并且又开始了搔挠的动作……
美军宪兵便再度给大川穿上衣服……
大川再次脱下衬衣，美军宪兵再次将衣服给其套上……
这样反复了多次。整个大厅里人们的目光都集中到大川周明和美国宪兵的身上，有人甚至发出了笑声，法庭庄重严肃的气氛被破坏了。
法官们被气坏了，严令美军宪兵制止大川的举动。那位宪兵便把手按在大川的肩上，用力地按住他。大川挣扎了一会儿，不知是累了，还是厌烦了同样的游戏，他回过头来对美军宪兵笑了笑，表情似乎在说：没事了，一切恢复正常。